Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC12A6-205ENST00000458406 4425 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CACNA1F-201ENST00000323022 6037 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SEMA6A-202ENST00000343348 6878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TNFAIP3-206ENST00000612899 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ATP2B2-202ENST00000360273 8962 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ERP44-201ENST00000262455 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MUC20-205ENST00000447234 2589 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 HOTTIP-203ENST00000521028 3345 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZFHX2-202ENST00000419474 9182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 EPN3-201ENST00000268933 4071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 RBM12B-201ENST00000399300 7269 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 CSPG4P13-202ENST00000567704 4801 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 TMPRSS13-205ENST00000526090 2592 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 AC015818.9-201ENST00000591705 4582 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
HERVK_113P63121 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms