Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC021146.12-201ENST00000608365 477 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CACNB3P54284 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms