Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 HIST1H4H-204ENST00000635491 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSG3P32926 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 OR52N4-201ENST00000317254 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 HNRNPH1P2-201ENST00000396845 1210 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC005954.2-201ENST00000586503 556 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 Metazoa_SRP.206-201ENST00000612004 332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 PSMC1P10-201ENST00000434820 1327 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 OR2A42-201ENST00000391496 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 OR2A1-201ENST00000408951 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AC012506.2-201ENST00000426527 533 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 RPL6P24-201ENST00000445338 864 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSG3P32926 PCBP1-AS1-242ENST00000458686 1020 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms