Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID4AP29374 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms