Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 THUMPD3-206ENST00000452837 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CANX-209ENST00000504734 2232 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MPPE1-202ENST00000317235 2324 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SLA2-201ENST00000262866 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RAB6A-201ENST00000310653 3389 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 FHOD3-207ENST00000591635 3035 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NOS3-203ENST00000461406 3644 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DRC7-203ENST00000394337 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ESR2-213ENST00000557772 5458 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TMEM200A-201ENST00000296978 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ADCK1-202ENST00000341211 1972 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 EFHC1-224ENST00000636702 2197 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 THSD1-201ENST00000258613 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC004241.1-201ENST00000547799 3299 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC010997.4-201ENST00000609200 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNFSF18Q9UNG2 AC102953.1-201ENST00000445345 498 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms