Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RNF7Q9UBF6 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RNF7Q9UBF6 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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RNF7Q9UBF6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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