Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 KCNH1-205ENST00000638498 3479 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 HPSE2-202ENST00000370549 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CELF4-218ENST00000591287 3757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CEP63-215ENST00000606977 2800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NAA15-202ENST00000398947 6072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PRAME-201ENST00000398741 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SLC11A1-201ENST00000233202 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 GRIPAP1-207ENST00000593475 2908 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 NUSAP1-208ENST00000559596 1629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 SLC35B3-201ENST00000379660 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
ERVK-18Q9QC07 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms