Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TGM7-201ENST00000452443 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZNF747-201ENST00000252799 3936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CHRNA7-223ENST00000637033 3204 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ESRRB-204ENST00000509242 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 FAM230B-208ENST00000451257 3566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PACSIN1-207ENST00000620693 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CLPX-201ENST00000300107 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 GPC4-201ENST00000370828 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CCDC112Q8NEF3 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms