Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HERC3Q15034 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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