Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA1SQ13698 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ACTG1P23-201ENST00000437653 1074 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SOX2-OT-203ENST00000466034 926 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC067942.1-202ENST00000471756 1057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LYRM1-202ENST00000396052 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SCGB1C1-201ENST00000342878 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 S100A6-202ENST00000368720 673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GAS6-AS2-201ENST00000608651 1952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL583804.1-201ENST00000448643 810 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AL645940.1-201ENST00000606432 594 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CHCHD7-218ENST00000523975 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SUCLG2-204ENST00000493112 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ORC5-203ENST00000447452 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SLC26A5-203ENST00000354356 2686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 FAM27E3-201ENST00000418795 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA1SQ13698 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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