Protein–RNA interactions for Protein: Q13489

BIRC3, Baculoviral IAP repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIRC3Q13489 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BIRC3Q13489 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BIRC3Q13489 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms