Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CFL1P6-201ENST00000400899 494 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC090004.1-201ENST00000608606 653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMPOP42166 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GBAP1-208ENST00000566701 1546 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC00943-204ENST00000537374 1688 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMPOP42166 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms