Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM182-201ENST00000409173 3198 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 IFI27L1-211ENST00000557066 580 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPB2P35606 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms