Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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HOXA13P31271 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HOXA13P31271 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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