Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJB2P29033 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJB2P29033 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJB2P29033 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GJB2P29033 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 DNAJC30-201ENST00000395176 2485 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SLC4A11-207ENST00000539553 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GJB2P29033 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 POLL-202ENST00000339310 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GJB2P29033 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms