Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SLC44A3-AS1-215ENST00000634870 5956 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 C5AR2-201ENST00000595464 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 NCBP1-202ENST00000375147 5178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
KNCNA6PVL3 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms