Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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TRAF6Q9Y4K3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE19-202ENST00000336455 1784 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAF6Q9Y4K3 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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