Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TRPM4-202ENST00000427978 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
DKK2Q9UBU2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150 ms