Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF7Q9UBF6 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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