Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ0

FBXO18, F-box DNA helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO18Q8NFZ0 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FBXO18Q8NFZ0 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms