Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TREX1-203ENST00000456089 629 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 IRF3-213ENST00000596765 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TRIM71Q2Q1W2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TRIM71Q2Q1W2 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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