Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MCAMP43121 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C1QTNF9-202ENST00000382071 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LINC01996-201ENST00000573270 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MCAMP43121 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms