Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ZSCAN5B-202ENST00000586855 2059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MCF2L-209ENST00000397036 1544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPOP42166 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 Z82244.1-201ENST00000631502 840 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TMPOP42166 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TMPOP42166 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms