Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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TNFSF9P41273 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TNFSF9P41273 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TNFSF9P41273 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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