Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AL139260.3-204ENST00000621281 609 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SLC50A1-214ENST00000622581 1245 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 IL4R-219ENST00000628578 201 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ZNF684-201ENST00000372696 1009 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CST11-202ENST00000377009 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RPL30-213ENST00000523172 274 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ZNF677-207ENST00000598806 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CALU-202ENST00000449187 2438 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATF3P18847 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PSMB8-201ENST00000374881 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 USP8-219ENST00000625664 1568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 TEDDM2P-201ENST00000414169 786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC025822.1-201ENST00000455525 633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FPGT-205ENST00000482102 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 RN7SL341P-201ENST00000613745 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AL161937.2-201ENST00000615503 403 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATF3P18847 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATF3P18847 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms