Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
XBP1P17861 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
XBP1P17861 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms