Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SMIM10L2BP0DMW5 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms