Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 DPP9-214ENST00000598800 3098 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
LTAP01374 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 A1CF-204ENST00000373997 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 SH3KBP1-202ENST00000379698 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
LTAP01374 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 LNP1-201ENST00000383693 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SFTPA1-202ENST00000419470 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC006033.2-201ENST00000609522 1968 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LTAP01374 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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