Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ARHGAP28Q9P2N2 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms