Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TREX2Q9BQ50 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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