Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NEK1-201ENST00000439128 5653 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 C1orf109-201ENST00000358011 2355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 AJ239328.1-201ENST00000626237 4807 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 ZNF41-202ENST00000377065 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RRN3P1Q2M238 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms