Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SPTBN1Q01082 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 LINC01823-204ENST00000438722 794 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TRIM37-201ENST00000262294 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SPATA18-201ENST00000295213 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC005746.2-201ENST00000585765 470 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
SPTBN1Q01082 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms