Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ERVV-1B6SEH8 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 COPS5-203ENST00000517736 1621 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 OR2T32P-201ENST00000403423 963 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC005096.1-201ENST00000560499 622 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PTGR1-205ENST00000407693 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 KRTAP10-11-201ENST00000334670 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TMEM106A-201ENST00000536052 1181 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC099524.1-203ENST00000565272 756 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 OR5L1-201ENST00000625203 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ERVV-1B6SEH8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms