Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GDPD5-204ENST00000526177 4150 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PDE4DIP-227ENST00000529945 8824 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 EPS15L1-201ENST00000248070 2924 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 FBLN2-207ENST00000492059 4193 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TBCCD1Q9NVR7 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC009549.1-201ENST00000603468 1686 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RGS16-201ENST00000367558 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 IKZF4-203ENST00000547167 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ORMDL2-201ENST00000243045 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AC009336.2-201ENST00000468418 3521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 RBPJ-203ENST00000345843 1682 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PHC2-201ENST00000257118 3870 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 CD99L2-203ENST00000370377 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 EPB41L1-206ENST00000373950 3631 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 TREH-201ENST00000264029 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TBCCD1Q9NVR7 DUSP4-202ENST00000240101 2959 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms