Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 BAIAP2-AS1-202ENST00000577066 4465 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 COL12A1-202ENST00000345356 5886 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CCDC144A-206ENST00000399273 8686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PDE4DIP-219ENST00000524974 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC055713.1-201ENST00000498967 8279 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 F2RL3-201ENST00000248076 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 L1CAM-202ENST00000361981 5004 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SREK1-202ENST00000334121 6781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
RETNLBQ9BQ08 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms