Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SGCZQ96LD1 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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