Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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ATP2A3Q93084 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ATP2A3Q93084 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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