Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HERC6Q8IVU3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HERC6Q8IVU3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HERC6Q8IVU3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HERC6Q8IVU3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HERC6Q8IVU3 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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HERC6Q8IVU3 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HERC6Q8IVU3 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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