Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TCF23Q7RTU1 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms