Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM69BQ5VUD6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms