Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC004147.4-201ENST00000636421 1844 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 XBP1-204ENST00000405219 1690 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HERC3Q15034 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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