Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LIMS1-205ENST00000410093 1526 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC073335.2-201ENST00000610177 3441 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CACNA2D2-202ENST00000360963 5272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CUL4A-203ENST00000375441 4037 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PCDHGA12-201ENST00000252085 4747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CCDC14-220ENST00000488653 4156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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PMS2P11Q13670 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PMS2P11Q13670 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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