Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP13P45452 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP13P45452 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP13P45452 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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MMP13P45452 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
MMP13P45452 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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