Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ADRA1A-210ENST00000519229 1838 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RASA1P20936 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms