Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ALG11-204ENST00000616513 1983 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TFE3P19532 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TFE3P19532 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms