Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
CTLA4P16410 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
CTLA4P16410 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
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