Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
F8W031 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
F8W031 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 SNCAIP-206ENST00000414317 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
F8W031 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
F8W031 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8W031 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8W031 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
F8W031 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms