Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CHPF2Q9P2E5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHPF2Q9P2E5 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms