Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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CCDC88CQ9P219 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
CCDC88CQ9P219 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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