Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRMT13Q9NUP7 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SRPK2P-201ENST00000523408 1100 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRMT13Q9NUP7 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms